免稅商品特許經(jīng)營(yíng)費(fèi)，其實(shí)是一種政府收入，專門針對(duì)免稅店收取，只有取得特許經(jīng)營(yíng)資格、能在機(jī)場(chǎng)、港口、車站、邊境口岸等海關(guān)監(jiān)管區(qū)域經(jīng)營(yíng)免稅商品的企業(yè)才需要繳納這筆費(fèi)用，免稅商品一般包括兩類一類是免征關(guān)稅、進(jìn)口環(huán)節(jié)稅的進(jìn)口商品，另一類是實(shí)行退稅進(jìn)入免稅店銷售的國(guó)產(chǎn)商品。
這項(xiàng)制度最早可以追溯到2004年，當(dāng)時(shí)財(cái)政部發(fā)布了文件，明確從2005年起對(duì)免稅商品經(jīng)營(yíng)企業(yè)征收特許經(jīng)營(yíng)費(fèi)，按年銷售收入的1%計(jì)算，后來(lái)隨著政策的發(fā)展，2006年財(cái)政部又發(fā)布了補(bǔ)充通知，對(duì)征收方式進(jìn)行了細(xì)化。
到了2011年，海南建設(shè)國(guó)際旅游島為了支持離島免稅政策，財(cái)政部等部門又出臺(tái)新規(guī)，要求離島免稅店按年銷售收入的4%上繳特許經(jīng)營(yíng)費(fèi)。
2018年，免稅商品特許經(jīng)營(yíng)費(fèi)由原來(lái)的財(cái)政部門管理，正式劃歸到稅務(wù)部門征收，這也是國(guó)家財(cái)政管理體系改革中的一部分。
中國(guó)免稅品（集團(tuán)）總公司、中國(guó)中旅集團(tuán)、深圳國(guó)有免稅公司、珠海免稅企業(yè)集團(tuán)、上海浦東機(jī)場(chǎng)免稅店、海南離島免稅購(gòu)物商店等，除此之外還有一些在出境航班、國(guó)際列車或輪船上銷售免稅商品的企業(yè)也需要繳納特許經(jīng)營(yíng)費(fèi)。
只要涉及向出境旅客、駐華外交人員、國(guó)際海員等人群銷售免稅商品的，都屬于繳費(fèi)主體。
企業(yè)每年結(jié)束后，需要在5個(gè)月內(nèi)完成繳費(fèi)申報(bào)，繳納的基準(zhǔn)是企業(yè)當(dāng)年的免稅商品銷售收入，按照規(guī)定比例計(jì)算應(yīng)繳金額。繳費(fèi)時(shí)，企業(yè)要以注冊(cè)會(huì)計(jì)師的審計(jì)報(bào)告為依據(jù)，清算當(dāng)年應(yīng)交金額，然后通過(guò)電子稅務(wù)局或辦稅服務(wù)廳，用《非稅收入通用申報(bào)表》完成上繳。
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